Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms