Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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FAM53CQ9NYF3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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FAM53CQ9NYF3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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FAM53CQ9NYF3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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FAM53CQ9NYF3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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FAM53CQ9NYF3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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FAM53CQ9NYF3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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FAM53CQ9NYF3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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