Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms