Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG7

SIRT3, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-3, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT3Q9NTG7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SIRT3Q9NTG7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIRT3Q9NTG7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms