Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms