Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBP3Q9NS15 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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LTBP3Q9NS15 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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LTBP3Q9NS15 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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