Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms