Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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RAB9BQ9NP90 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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RAB9BQ9NP90 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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RAB9BQ9NP90 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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