Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms