Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms