Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
APOBEC3GQ9HC16 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms