Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1EQ9GZS1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms