Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms