Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms