Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms