Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ROPN1BQ9BZX4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ROPN1BQ9BZX4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ROPN1BQ9BZX4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ROPN1BQ9BZX4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ROPN1BQ9BZX4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ROPN1BQ9BZX4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ROPN1BQ9BZX4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ROPN1BQ9BZX4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ROPN1BQ9BZX4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ROPN1BQ9BZX4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ROPN1BQ9BZX4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ROPN1BQ9BZX4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ROPN1BQ9BZX4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ROPN1BQ9BZX4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ROPN1BQ9BZX4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ROPN1BQ9BZX4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ROPN1BQ9BZX4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ROPN1BQ9BZX4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ROPN1BQ9BZX4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ROPN1BQ9BZX4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ROPN1BQ9BZX4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms