Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BCO2Q9BYV7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms