Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms