Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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