Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms