Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms