Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms