Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
CCDC43Q96MW1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms