Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms