Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOLD1Q96LR9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOLD1Q96LR9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms