Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms