Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 WDYHV1-201ENST00000287387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 Z97198.1-201ENST00000452366 658 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 OR4C5-201ENST00000319813 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 MED20-203ENST00000409060 815 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AL157702.2-201ENST00000428292 1223 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 LINC02509-201ENST00000508790 691 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC007991.4-201ENST00000522970 605 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms