Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFHD2Q96C19 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms