Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms