Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms