Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms