Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRAT1Q92837 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRAT1Q92837 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms