Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms