Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC21AQ8NDW8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms