Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF2

FOXRED2, FAD-dependent oxidoreductase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXRED2Q8IWF2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXRED2Q8IWF2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED2Q8IWF2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms