Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms