Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ3

TXNDC2, Thioredoxin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC2Q86VQ3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TXNDC2Q86VQ3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TXNDC2Q86VQ3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TXNDC2Q86VQ3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TXNDC2Q86VQ3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TXNDC2Q86VQ3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TXNDC2Q86VQ3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TXNDC2Q86VQ3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TXNDC2Q86VQ3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TXNDC2Q86VQ3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TXNDC2Q86VQ3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TXNDC2Q86VQ3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TXNDC2Q86VQ3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TXNDC2Q86VQ3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TXNDC2Q86VQ3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms