Protein–RNA interactions for Protein: Q86UE6

LRRTM1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM1Q86UE6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM1Q86UE6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms