Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
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