Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVN7

SEM1, Putative protein SEM1, isoform 2, humanhuman

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Length 128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1Q6ZVN7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEM1Q6ZVN7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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