Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms