Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms