Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms