Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms