Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms