Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIF1Q5UIP0 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIF1Q5UIP0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIF1Q5UIP0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIF1Q5UIP0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIF1Q5UIP0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIF1Q5UIP0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIF1Q5UIP0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIF1Q5UIP0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RIF1Q5UIP0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIF1Q5UIP0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIF1Q5UIP0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIF1Q5UIP0 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIF1Q5UIP0 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIF1Q5UIP0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIF1Q5UIP0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIF1Q5UIP0 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIF1Q5UIP0 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIF1Q5UIP0 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIF1Q5UIP0 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RIF1Q5UIP0 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RIF1Q5UIP0 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIF1Q5UIP0 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIF1Q5UIP0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIF1Q5UIP0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIF1Q5UIP0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIF1Q5UIP0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIF1Q5UIP0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms