Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHSL1Q5SYE7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms