Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms