Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms