Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms